Nieuws Nieuwe Europese samenwerking met Innovative Medicine Initiative wil grootste pathologie databa
28 januari 2021

Om de ontwikkelingen van artificiële intelligentie (AI) in de pathologie te versnellen, gaat een Europees consortium een database ontwikkelen waarin pathologie-data gedeeld kunnen worden. Dit consortium bestaat uit toonaangevende Europese onderzoekscentra, ziekenhuizen en farmaceutische bedrijven. Het project, dat wordt gecoördineerd door Jeroen van der Laak en Katrien Grünberg van het Radboudumc, draagt de naam BIGPICTURE. Met een duur van zes jaar en een investering van 70 miljoen euro luidt het project een nieuw tijdperk in voor de pathologie.

 

Pathologie vormt een hoeksteen bij de bepaling van ziektes zoals kanker, auto-immuunziekten en het monitoren van de effecten na transplantatie. Pathologie is daarnaast ook cruciaal bij het analyseren van de veiligheid van medicijnen. Het berust allemaal op onderzoek van weefsels onder de microscoop. Ondanks die centrale rol is de beoordeling van het weefsel nog altijd sterk afhankelijk van een gekwalificeerde patholoog.

 

Hoewel de microscoop het symbool is van de pathologie, zorgt de digitalisering van de weefselcoupes de afgelopen jaren voor een revolutie: niet alleen kunnen afbeeldingen nu gedeeld en bekeken worden over de hele wereld, ze kunnen ook geanalyseerd worden door computers. Dit opent deuren voor artificiële intelligentie (AI) om de patholoog te ondersteunen bij het bestuderen van ziektebeelden en het vinden van betere behandelingen. Daarnaast kan het bijdragen aan het vervangen, verminderen en verbeteren van dieronderzoek. Het ontwikkelen van AI toepassingen vergt een enorme hoeveelheid data. In het geval van de pathologie betekent dit, dat er een enorme collectie van digitale foto’s en medische data voor de interpretatie ervan nodig is. Het delen hiervan blijkt lastig door de vertrouwelijke aard van de informatie die gedeeld moet worden en de gigantische opslagcapaciteit die hiervoor nodig is.

 

Om de ontwikkelingen van AI in de pathologie te versnellen, richt het BIGPICTURE project zich op het creëren van het eerste Europese, ethische en GDPR-compliant (General Data Protection Regulation), kwaliteit-gecontroleerd platform, waarbij grote gegevensbestanden en AI algoritmes gecombineerd worden. Dit BIGPICTURE platform wordt ontwikkeld in een inclusieve en duurzame manier door pathologen, onderzoekers, AI ontwikkelaars, patiënten en farmaceutische bedrijven.

 

Het project bestaat uit vier onderdelen vanwege de grote omvang van de data collectie. Allereerst moet er een (hardware en software) infrastructuur gemaakt worden om het opslaan, delen en verwerken van miljoenen afbeeldingen (die per stuk gigabytes groot kunnen zijn) mogelijk te maken. Daarnaast is het belangrijk de privacy van de patienten en de vertrouwelijke data te bewaken door wettelijke en ethische richtlijnen vast te stellen. Vervolgens wordt eerst een collectie van drie miljoen digitale coupes van mens- en dierlaboratoria verzameld en opgeslagen in de database om de AI applicaties verder te ontwikkelen. Uiteindelijk zullen AI onderdelen worden ontwikkeld die helpen bij het gebruiksgemak van de database en het verwerken van de foto’s voor diagnoses en onderzoeksdoeleinden.

 

BIGPICTURE is een publiek-private samenwerking gefinancierd door IMI, met vertegenwoordigers van academische instituten, kleine en middelgrote ondernemingen, publieke organisaties en farmaceutische bedrijven. De partners bestaan uit: Radboudumc (NL), Linköping university (SE), Leeds Teaching Hospitals NHS Trust (UK), Universitair Medisch Centrum Utrecht/UMC Utrecht (NL), CSC – IT Center for Science Finland (FI, ELIXIR node), Uppsala University (SE, ELIXIR node), Fraunhofer-Gesellschaft zur Förderung der angewandten Forschung e.V.(DE), Haute Ecole Spécialisé de Suisse Occidentale (CH), Technischel Universiteit Eindhoven (NL), Azienda Ospedaliera Per L’Emergenza Cannizzaro (IT), University of Warwick (UK), Technical University of Munich (DE), Medical University Graz (AT), Institut Pasteur (FR), University of Liege (BE), University of Semmelweis (HU), Nederlands Kanker Instituut (NL),  Biobanks and biomolecular resources research infrastructure (AT), Deutsches Institut für Normung E.V. (DE), Region Östergötland (SE), Medical University Vienna (AT), European Institute for Innovation through Health Data (BE), Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiirin kuntayhtymä (FI), University of Marburg (DE), European Society of Pathology (BE), Digital pathology association (US), GBG Forschungs Gmbh (DE), ttopstart (NL), Sectra AB (SE), Cytomine SCRLFS (BE), Stichting Lygature (NL), Owkin (FR), Deciphex (IE), MedicalPhit (NL), Timelex (BE), Novartis Pharma AG (CH), Janssen Pharmaceutica NV (BE), Bayer AG (DE), Boehringer Ingelheim International GmbH (DE), Novo Nordisk A/S (DK), Pfizer, Genentech – Roche (US), Sanofi Aventis recherche et Développement (FR), Institut de Recherches Internationales Servier (FR), and UCB Biopharma SRL (BE).

BIGPICTURE start op 1 februari 2021. Hoewel het project zelf zes jaar zal duren, is het de bedoeling dat het platform zal blijven bestaan en zal het consortium samenwerken voor duurzame/langdurige plannen om het systeem te blijven ontwikkelen en onderhouden.

Disclaimer

Dit project is gefinancierd door het IMI 2 Joint Undertaking, grant agreement nummer 945358. Deze Joint Undertaking krijgt ondersteuning van de European Union’s Horizon 2020 onderzoek en innovatie programma en EFPIA. www.imi.europe.eu

Dit bericht reflecteert de visie van het consortium. IMI, de EU of EFPIA zijn niet verantwoordelijk voor het gebruik van of de informatie van dit bericht.

        

Meer nieuws


Artificiële Intelligentie voor betere preventie van dementie AI-Mind project ontwikkelt platform voor snelle, vroege diagnostiek

23 februari 2021 Het internationale AI-Mind project, waaraan ook het Radboudumc deelneemt, gaat slimme digitale instrumenten ontwikkelen om hersenverbindingen te screenen en het risico op dementie in te schatten bij mensen met milde cognitieve problemen. lees meer

Nieuw lab voor AI in gezondheid, gedrag en voeding

12 februari 2021 Het nationale Innovation Center for Artificial Intelligence (ICAI) opent een nieuw lab gericht op gezondheid, gedrag en voeding. Bij dit nieuwe OnePlanet ICAI-lab for Precision Health, Nutrition and Behavior zijn Radboud Universiteit, Wageningen en Radboudumc betrokken. lees meer

Tuberculosevaccin biedt kwetsbare ouderen geen bescherming tegen COVID-19 Eerste resultaten BCG-PRIME studie

18 januari 2021 Het BCG-vaccin biedt kwetsbare ouderen geen bescherming tegen ziekteverschijnselen door COVID-19. Dat zijn de eerste resultaten van de BCG-PRIME studie onder 6132 kwetsbare patiënten van 60 jaar en ouder. lees meer

Wanneer is virtueel realistisch genoeg? Vijfde aflevering podcast 'AI for Life'

8 januari 2021 In de vijfde aflevering van de podcastserie 'AI for Life' aandacht voor het gebruik van ‘virtual agents’ om mensen te trainen en voor te bereiden op concrete werksituaties. lees meer

Radboudumc bij Innovate Meet-Up op Novio Tech Campus

8 december 2020 Vanavond vindt op de Novio Tech Campus in Nijmegen een Meet-Up plaats die wordt georganiseerd door Innovate. Iedereen kan meekijken, want het complete programma wordt via diverse kanalen gestreamd. lees meer

Tweede podcast 'AI for Life' Interactie mens en robot staat centraal

8 oktober 2020 De tweede aflevering in de podcastserie 'AI for Life' gaat over de rol van robots in de zorg. Het promotieonderzoek van Roel Bouman naar het gebruik van robots in de ouderenzorg was daarvoor het uitgangspunt. lees meer
  • Medewerkers
  • Intranet